肺部感染的细菌繁多，根据革兰染色特性可以分为革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌，按照细菌生长对氧气的需求，又可以分为需氧菌和厌氧菌以及兼性厌氧菌，而根据细菌形状又可以分为球菌、杆菌。
具体常见的细菌有肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、化脓性链球菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯杆菌、炭疽杆菌、鲍曼不动杆菌、军团菌等，其中以肺炎链球菌最为常见，占到肺部感染细菌的50%-70%。
肺炎链球菌感染时，可引起胃寒、高热以及咳嗽、咳痰，甚至胸痛等临床表现，而肺炎链球菌对青霉素类的药物比如阿莫西林、哌拉西林等药物都比较敏感。因此，肺部感染需要根据具体的细菌或者根据药敏试验选择用药。