重度的甲状腺功能减退会影响垂体性腺功能，导致很难怀孕。轻度或者亚临床的甲状腺功能减退一般不影响怀孕，但是轻度或者亚临床甲减妇女如果甲状腺功能没有纠正到正常，一旦怀孕会影响胎儿的神经系统发育，导致出生后子代的智商有所下降。
如果甲减妇女通过甲状腺替代治疗，使甲状腺功能恢复正常，在这种情况下怀孕，怀孕过程中及时的调整甲状腺激素的用量，使甲状腺激素水平在妊娠的正常值之内，这种情况下甲减的妇女同样可以生出聪明、健康的宝宝。
所以重度的甲状腺功能减退很难怀孕，亚临床或者轻度的甲状腺功能减退妇女能够怀孕，但是有可能影响子代智商。甲减妇女通过甲状腺激素替代治疗使甲功恢复到正常，这种情况下怀孕不影响子代的智商和健康。