六味地黄丸的水丸和蜜丸效果一样，不存在谁比谁效果更好的问题。六味地黄丸属于中医中补益剂中补阴剂的范畴，由熟地黄、山茱萸、山药、茯苓、丹皮、泽泻六味药组成。其主要功效是滋补肝肾，可以用来治疗肝肾阴虚证所引起的腰膝酸软、头晕目眩、耳鸣耳聋、两颧红赤、口燥咽干、虚火牙痛、骨蒸潮热、手足心热、夜间盗汗，男子会出现遗精，小儿会出现囟门不合、舌红少苔或无苔、脉细数。
六味地黄丸以肾、肝、脾三阴并补而重在补肾阴为主，方中熟地黄滋肾阴、益精髓，山茱萸滋肾益肝，山药滋肾补脾，共成三阴并补以收补肾治本之功。泽泻配熟地泻肾降浊，丹皮配山茱萸泻肝火，茯苓配山药渗脾气湿。六味药组合在一起，具有非常好的滋补肝肾的作用，对于肝肾阴虚证有不错的治疗效果。六味地黄丸的水丸和蜜丸只是剂型不同，组成、功效、主治完全一样，所以效果也一样，并不存在谁的效果更好，谁的效果更差的问题。