痛风石主要成分是尿酸盐结晶，血液中持续高浓度的尿酸是形成痛风石的基础。痛风石的形成的速度与大小、多少与血尿酸浓度的高低，以及持续的时间成正比。痛风石出现，实际上是扩大了尿酸钠盐池。
痛风石形成的典型部位在耳轮，也可以在关节炎反复发作的部位出现。通常关节腔内的痛风石会比皮肤上的痛风石出现早，沉积在关节腔或关节附近的痛风石，可破坏关节引起骨质侵蚀、缺损，甚至造成关节畸形。
如果痛风石出现在肾脏中会导致肾绞痛发作，出现镜下血尿，甚至引起肾盂积水、继发感染导致肾衰竭。