腘静脉血栓的治疗包括以下几种方法：
第一、对于急性期腘静脉及伴随着股静脉的血栓，可以采用介入下吸栓的方法。在吸栓之前先安放下腔静脉滤器，以防止血栓脱落，临床上现采用Angiojet进行吸栓，先注入溶栓药物，溶栓15-20分钟之后再进行吸栓。
第二、对于单纯的腘静脉血栓，也可以采用介入下置管溶栓的方法，溶栓时间6-12小时，可以很好的消除腘静脉血栓。
第三、对于静脉慢性的股静脉血栓，采用抗凝治疗，住院时间可以采用低分子肝素，出院后口服利伐沙班3-6个月，并定期复查，同时辅以弹力袜加压治疗，可以避免腘静脉血栓复发。大部分腘静脉血栓在口服抗凝药，3-6个月后可以实现再通，甚至部分血栓可以消失。