莫西沙星属于喹诺酮类抗生素，头孢属于β-内酰胺类抗生素。莫西沙星对于18岁以下患者是禁用的，头孢类对于有些孕妇也可以使用，相对而言头孢类抗生素比较安全一些。
莫西沙星主要用于治疗一些泌尿系感染、肠道感染、呼吸系统感染等，在注射剂当中属于特殊级抗菌药，属于价格比较贵、安全性相对比较低、副作用比较大的一种抗生素。头孢菌素在价格方面相对而言便宜一些，不良反应更少一些。