附睾囊肿从理论上是不影响生育的，但是有一些情况下，附睾囊肿是由于急性或慢性的附睾炎迁延不愈而导致，这种情况下就可能会影响精子数和精子的活动力，甚至引起精子的畸形率过高等。
附睾囊肿如果没有特殊的临床症状，或者不是由于附睾囊肿过于增大，导致影响行走，会有阴嚢的不适感、坠胀以及疼痛这些情况，附睾囊肿就不需要手术进行治疗了，附睾囊肿是没有很明确的口服药可以治疗的，出现附睾囊肿，要判断是否合并附睾炎。如果合并附睾炎，可能是影响生育，所以说出现附睾囊肿，建议要在专业医院的专业医生指导下进行诊断和治疗，同时也不要因为附睾出现囊肿，就产生过多的心理压力。