HLA-B27阳性并不能够确诊为强直性脊柱炎，正常人群中，阳性率也可达6%-8%，只是强直性脊柱炎患者的阳性率相对较高，可以达到90%以上，在其它血清阴性的脊柱关节病中，莱特尔综合征阳性率可以达到60%-80%左右，银屑病关节炎阳性率为50%左右。
对于强直性脊柱炎的诊断，除了依靠HLA-B27阳性以外，还需要结合患者的临床症状、影像学检查，典型的临床症状主要表现为腰背部疼痛、不适，同时可能会伴有晨僵，甚至会出现夜间翻身受限，典型的影像学检查通常会出现骶髂关节改变，严重的患者可能表现为骶髂关节间隙的融合、完全强直。