乙肝病毒的窗口期是从乙肝病毒感染之后到第一次发现感染了乙肝病毒，这段时期就叫做乙肝病毒的窗口期。窗口期要远远的短于潜伏期，每个人窗口期的时间并不一样，通常乙肝病毒感染之后的窗口期是两周到六个月，最长是六个月。通常来讲，在一个月之内能够检测出乙肝病毒感染的情况。
目前，乙肝病毒检测的方法最主要的是乙肝五项定量，如果发现乙肝五项当中乙肝表面抗原是阳性，或发现乙肝病毒DNA定量是阳性，就代表感染了乙肝病毒。