甲状腺囊肿一般不会是恶性肿瘤的，囊性肿瘤比较常见的是良性肿瘤，包膜比较完整，周边的界限比较清楚。囊肿内一般是液体性东西，一般情况下囊肿常见的是良性肿瘤，不用过分担心的。
恶性肿瘤是实性肿瘤，一般边界不够清楚，生长成侵润性生长，生长速度比较快，而且很容易发生淋巴结肿大和转移的。如果是甲状腺囊肿<3cm的、没有症状的一般都不需要治疗，只有当甲状腺囊肿比较大，出现了压迫症状时，才需要进行手术治疗，一般甲状腺囊肿也不会发生恶变的。