脂肪肝是由于肝细胞内脂肪堆积过多引起的肝功能、肝细胞的损伤，这个时候会出现生化学中转氨酶的升高，转氨酶升高主要以谷草转氨酶和谷丙转氨酶升高为主。
但如果长期慢性的肝脏损坏，也会引起谷酰转肽酶的升高。对于脂肪肝来说，血脂也是一个重要指标。脂肪肝多伴有血脂升高，也就是甘油三酯、胆固醇这些指标的升高。
还有在物理诊断中，目前比较流行的是肝脏的弹性测定，也叫FibroScan，FibroScan的值如果很高，提示脂肪堆积量也会比较高，FibroScan的结果中，有含有脂肪量的一个测定。