扁桃体肥大有生理性的原因，也有病理性的原因。生理性的扁桃体肥大多见于儿童，一般无明显症状，扁桃体表面光滑，与周围组织没有粘连，这种情况不需要处理，到青春期以后扁桃体会逐渐萎缩。
病理性的扁桃体肥大，其中一种原因是急性扁桃体炎反复发作，迁延不愈，转为慢性，如果是扁桃体肥大反复发炎或是睡眠打鼾、张口呼吸有憋气的情况，建议手术切除。还有一种原因是扁桃体恶性肿瘤引起的扁桃体增生、肥大，多为单侧，表面有溃疡，一般需要病理检查确诊。