卵巢囊肿要挂妇科门诊并且如果分科比较细，可以挂妇科肿瘤，建议了解该院的分科情况，如果分科不细，直接挂妇科就可以了。
卵巢囊肿在临床上病因还不清楚，但是需要提醒的是有生理性囊肿，也有病理性囊肿，生理性囊肿常常是因为黄体形成，没有及时萎缩才表现为囊肿，在月经干净以后明显缩小或者消失。
如果是病理性囊肿，建议在临床上积极的手术治疗，并且将切除的囊肿送病理化验，临床最终以病理诊断为准，并且在术后也要定期复查，因为有些囊肿可能会复发，比如卵巢的巧克力囊肿复发的可能性就非常高。