重度牙周炎主要表现为牙槽骨的吸收、牙齿松动甚至脱落、部分磨牙发生根分叉病变、出现牙周牙髓联合病变。治疗时首先要对引起牙龈红肿、出血、萎缩的牙结石进行彻底的清除，手工刮治根面附着的牙结石后，进行根面平整术。超过三度以上的松动牙，预后较差，需要尽早拔除。
牙周牙髓联合病变的患牙，可以摘除牙髓完成根管治疗，控制根尖病变。磨牙根分叉吸收不超过两度时，可以进行牙周翻瓣手术，刮除病变区的肉芽组织，植入骨粉、骨膜形成新的牙周愈合。缺失牙要及时进行种植或活动义齿修复。