儿童扁桃体切除手术是一个很常见的手术，也是一个很成熟的手术，但是儿童扁桃体切除手术需要有严格的手术指征，最常见的手术指征就是影响了呼吸，比如睡觉打呼噜，影响睡眠，张嘴呼吸；再就是影响吞咽功能，扁桃体特别大，小孩子在吞咽时有吞咽阻挡感或者影响发音，扁桃体炎反复的急性发作，一年超过四次以上。
这些都是有严格手术指征的，达到手术指征以后才会考虑儿童的扁桃体切掉，毕竟扁桃体是人体免疫组织的一部分。在切除扁桃体后短期的后遗症有可能是常说的疼痛、发音的改变，长期的后遗症没有很大的，有很多家长也是比较担心这个问题，所以术前咨询也是最多的这个问题，担心孩子切除扁桃体后免疫力会不会受影响，完全没有必要担心。
因为扁桃体属于咽腔淋巴环的一部分，是最大的两个淋巴组织，所以切除这两个最大的淋巴组织以后，剩余的淋巴组织发挥正常免疫作用，不会有什么很大的后遗症。