苯妥英钠对大脑皮层运动区，有高度的选择性抑制作用。因此它可以治疗，复杂部分性癫痫发作、单纯部分性发作、全身强直性阵挛性发作，和癫痫持续状态。
不仅如此苯妥英钠在脑组织中达到有效浓度，时间比较慢，因此疗效出现会十分缓慢，需要连续多次服药才能够有效。除此之外它还能够治疗三叉神经痛、坐骨神经痛、发作性舞蹈手足徐动症、发作性控制障碍、肌强直症，以及隐性营养不良性大疱性表皮松解。
在心内科还用于治疗室上性或室性早搏、室性心动过速，尤其适合强心苷中毒时的室性心律失常。