睡眠障碍的药物治疗效果，一般根据睡眠的情况来决定。对于入睡困难的患者，可以选用短效的睡眠，药物效果会比较好。此类药主要是诱导睡眠的作用，常用的药物有思诺思、佐匹克隆等。对于睡眠维持障碍的患者，可能要选用中效的安眠药物，效果可能会比较好，一般选安定或者舒乐安定，对于睡眠维持障碍的患者效果会比较好。
还有伴随睡眠障碍以及存在焦虑、抑郁等精神症状的患者，可能要用三环类抗抑郁药如多虑平，或者用5-羟色胺再摄取抑制剂，如舍曲林，或者百优解等药物，可以改善睡眠，也可以改善精神症状。