正常情况下，生理性卵巢囊肿不需特殊处理，经过1-2次月经后就会逐渐消退，不用过于担心。
卵巢囊肿包括多种，包括生理性囊肿、炎性包块、卵巢浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等卵巢肿瘤以及卵巢巧囊等等，各有各自的特点，需要做出鉴别和处理。生理性囊肿相对比较常见，一般直径小于3-4cm，囊壁薄，常常在来过1-2次月经之后，月经刚干净时复查B超会消退，这是生理性囊肿的主要特点。如果持续存在不消退，就要怀疑卵巢肿瘤。卵巢巧克力囊肿B超比较有特点，一般表现为壁厚的中等大小囊肿，囊内充满点状强回声或者短线样强回声。
建议生理性卵巢囊肿患者平时随诊观察，定期复查就可以，不需要进行药物或者手术治疗。平时多注意阴道清洁卫生，避免服用激素类药物，减少对卵巢的损害。