肛瘘的治疗不分男性和女性，男女都一样，治疗的首选方法是手术。术中要探查有没有外瘘口，通过外瘘口探查内瘘口，把内、外瘘口贯通，挂线治疗。但是肛瘘大部分原因是肛周感染引起的肛周皮肤红肿，形成脓肿的过程，脓肿破溃之后，就形成了外瘘口。外瘘口破溃、脓液引出，就形成了窦道，通过窦道找到内瘘口。手术不只是单纯的把肛周脓肿切开，要把内、外瘘口完全贯通、挂线，加上术后常规的换药，以预防假性的愈合。如果女性患者患有肛瘘，建议去正规的医院治疗，要用挂线的疗法，不只是单纯的切除窦道，不只是单纯的切开引流。