卵巢囊肿是生长在卵巢部位出现了囊肿，手术可以通过腹腔镜进行，也可以开腹进行。手术包括肿物剥除以及患侧的输卵管卵巢切除，如果肿物怀疑恶性，可以做冰冻检查。如果证实是恶性，手术的方式就要扩大。一般来讲，单纯的卵巢囊肿进行腹腔镜手术前，要进行相应的麻醉评估以及术前检查，除外手术禁忌，然后需要选择全麻进行手术。手术时要在肚脐部穿刺，然后在腹腔内注气，待腹部膨隆以后，再在腹部的两侧分别做第2-3穿刺孔，必要的时候再做第四个穿刺孔，然后放置腹腔镜及相应的器械。
如果是肿物剥除，就将肿物从卵巢表面划开一个口，去除包膜将肿物完整取出，将其放置在垃圾袋中，从穿刺口来取出肿物，并且局部进行电凝止血或者是缝合，然后检查没有出血后放出多余的气体，取出器械缝合切口，这是手术的过程。