对于短暂性抽动障碍的治疗，先要根据引起因素进行治疗，应祛除不良因素，包括患者生活习惯，少看电视、电脑、手机，不要吃刺激、辛辣、油炸的食物，配合新鲜的牛奶，不要喝刺激的饮料。同时，可以通过心理咨询使患者放松，可以改善症状。
如果还不行，可以用一些药物，包括营养神经的甲钴胺、外源性维生素B，或者扩张血管的尼莫地平等，可以改善症状。如果达不到目的，可以用调整神经递质的药物，常用的药物是硫必利，相对来说效果可以的，但会有副作用，要注意观察药物副作用的情况。如果硫必利无效，可以换氟哌啶醇、舒必利等，但副作用都相对大一点。