细菌性阴道炎的治疗，主要选择抗厌氧菌的药物，主要有甲硝唑、替硝唑、克林霉素，由于甲硝唑可抑制厌氧菌的生长，而不影响乳杆菌的生长，是比较理想的治疗药物。但是具体的使用药物，要在医生的指导下进行使用，不能自己盲目使用药物，可能会加重病情，要针对具体的病情进行治疗。
细菌性阴道病临床特点是带有鱼腥臭味的稀薄阴道分泌物增多，可伴有轻度的外阴瘙痒或烧灼感，在性交之后症状会加重。但是检查阴道黏膜的时候，没有明显充血等炎症表现的。细菌性阴道病分泌物是呈鱼腥臭味，是由于厌氧菌产生的胺类物质所导致的。