抗生素类药物种类繁多，不同的抗生素半衰期均不相同，在体内完全代谢掉所需要的时间不能一概而论。
一般药物完全代谢需要5-6个半衰期时间，根据大多数药物的半衰期推断，静点、肌注或口服抗生素后大约3-5天左右，大部分的抗生素就可代谢完毕，保守推算，延迟到1周基本不会有影响。在此期间多喝水，促进排尿，可以促进药物代谢。例如某种抗生素半衰期为8小时，药物清除大约需要2天左右，但还需要考虑到药物的后遗效应。有些药物虽然代谢晚，但还有药效存在，叫做后遗效应，需要更长的时间才会消失。一般能够引起双硫仑样反应的抗菌药物，主要包括头孢菌素类抗生素中的绝大多数品种。总体来说不同的抗生素代谢时间都不一致，如果想对某种药物明确了解，建议针对不同的药物咨询药师或者医生。
患者服用抗生素期间要注意，大多数抗生素都建议在餐后一小时左右服用，可以有效减少抗生素对胃肠道黏膜的刺激作用，减少出现胃肠道不适症状的风险。另外，抗生素一定要严格按照医嘱或者说明书的用法、用量来使用。