囊胚移植的成功率，目前全国的平均水平大约在50%，而卵裂期胚胎的移植成功率大约在40%左右。囊胚移植的妊娠率比卵裂期胚胎的移植高一些，原因是多方面的，单从胚胎自身的角度来讲，能够养成囊胚的胚胎，胚胎发育潜能比较好，从第三天到培养至第5-7天，会有一部分胚胎的发生停止发育的情况。如果培养至第三天就移植，有可能发生在女性的体内表现为没有成功妊娠，进行囊胚培养，相当于在体外的环境中进一步自然淘汰，这样能够养成囊胚，并且移植到女性体内的肯定是优胜者，所以成功率也是比较高的。
囊胚移植的成功率也受多方面因素的影响，比如女性的内膜情况、种植窗的选择、内膜准备方案的选择，以及女性整个内分泌的状态等等，都是影响因素。胚胎是否能培养成囊胚，囊胚的质量如何，也只是影响成功率的原因之一，而并不是起到决定性的作用。所以在选择囊胚移植，还是卵裂期胚胎移植的时候，也要综合进行考虑，不能因为盲目的追求妊娠率而去选择囊胚移植，毕竟囊胚移植也是有风险的，有可能在第三天还有可移植的胚胎，但是继续往后培养，胚胎全部都发生停滞，这种情况下就会面临没有可用胚胎的情况，这种情况是比较难以接受的。所以不管选择哪种移植方式，都要综合考虑，听取专业医生的建议。
