胃肠间质瘤的治疗方法具体如下：
1、看有没有手术治疗的指征，如果有手术治疗指征尽可能做手术切除，这是胃肠间质瘤主要的治疗方法之一；
2、术后采用靶向药物或者术前采用靶向药物进行新辅助治疗。
对于适合手术切除的病人，术后采用针对间质瘤的靶向药物，如伊马替尼、尼洛替尼等靶向药物，可以减少术后复发。而如果对于初诊肿瘤比较大，无法手术切除情况的，可以采用靶向药物进行新辅助治疗，让肿瘤缩小以后再行手术切除的治疗方法。总之间质瘤离不开手术，也离不开术后的靶向药物进行治疗。