通常情况下，蛋白S偏低不是怀孕整个过程打肝素的指标，要根据具体情况进行分析。
肝素钠主要用于抗凝血的治疗，是一种由两种多糖组成的抗凝血剂。具有体内外抗凝的作用，主要是应用于血栓栓塞症、心肌梗死、血管外科的血栓、心导管插入、体外循环、血液透析等情况。如果女性有多次的胚胎停育史，结合蛋白S偏低，可以在早期应用肝素。到孕28周左右，要停掉肝素或者检查相关的指标。如果孕28周相关的指标仍然不太正常，建议最多打到34周，一般肝素要在36周之前停掉。因为36周以后，孕妇随时可能发动宫缩，长期的肝素治疗可能影响生产或者手术的操作。
怀孕期间打肝素针有预防胎停的作用，注射肝素针时孕妇可以采取半卧位。注射时不需要排除注射器里的空气，只需要把药液里的小气滴弹出来，打针的位置可以在肚脐附近或者胳膊、大腿处。