扁桃体炎和肾炎是有直接的关系，扁桃体如果反复发炎，就会累及到肾脏，从而引发肾炎。肾炎最主要的致病因素是溶血性链球菌，而扁桃体炎最主要的致病因素也是溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎球菌等，所以炎症不能及时控制，而累及到肾脏的情况下，就会出现肾炎，从而出现腰膝酸软或者是腰疼，查体可以见到腹部有压痛，或者是查肾功有异常等。扁桃体如果反复发炎，最好还是手术切除为好，否则很容易会出现机体的其他并发症，比如心肌炎、肾炎、关节炎等。