智齿冠周炎患者的治疗，主要是以消炎、镇痛、急性期切开引流、增强全身抵抗力为主，可以口服头孢类的药物，或甲硝唑、奥硝唑。当炎症进入慢性期之后，根据不同的病情程度来拔除无法保留的智齿。在急性期进行局部冲洗，主要用双氧水、生理盐水冲洗盲袋，把里边的食物残渣、脓性分泌物冲洗出来，擦干后局部可以上碘甘油或者碘伏。另外，根据局部炎症全身反应的程度，选择性的使用抗生素，抗生素的使用需要兼顾革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌，还需要兼顾厌氧菌和需氧菌，这个时候可以口服头孢类的药物，或者甲硝唑、奥硝唑。另外，对于牙龈局部形成脓肿，需要进行切开引流，放置引流条。
当感染进入慢性期之后，张口受限改善，牙龈局部炎症已经消退，这个时候需要拍摄牙片。对于无法保留的智齿，建议尽早拔除。对于能萌出的智齿，如果位置比较好，而且有对(牙合)牙，这个时候可以进行牙龈切除助萌术，促进智齿的萌出。