血脂异常与甲状腺疾病有一定关系，血脂异常又分为原发性和继发性两种。继发性血脂异常，主要指的是由于某种疾病所引起血脂异常，其中最常见疾病包括甲状腺功能减退症。甲状腺功能减退症主要是由于各种原因，导致甲状腺腺体本身病变使甲状腺激素分泌不足，或者是甲状腺激素不敏感综合征。
甲状腺激素在体内具有重要作用，甲状腺激素可以促进脂肪合成与降解，但主要以降解为主。甲状腺激素影响脂类代谢作用，包括动员脂肪组织内储存的甘油三酯，增强脂质物质底物利用，以及增强苷酯酶和胆固醇转移蛋白活性。因此，甲状腺激素可以影响血脂水平。甲减是导致血脂异常最常见原因，最常见是高胆固醇血症。