植物神经功能紊乱的治疗主要是在心理方面进行疏导，去除植物神经功能紊乱的诱发因素，还有使用药物来进行治疗。调节植物神经常用的药物有谷维素、维生素B1，患者如果有心慌的症状可以口服小剂量的心得安，如果有胃肠功能紊乱比如胃胀或者腹泻等症状，可以使用胃蛋白酶片或者多酶片。有失眠的患者睡前可以服用地西泮、右佐匹克隆、艾司唑仑这类的药物，如果患者还有焦虑、抑郁的情绪可以使用抗焦虑、抗抑郁的药物进行对症的治疗，临床上常用的草酸艾司西肽普兰还有黛力新。患者患有植物神经功能紊乱也可以就诊中医内科，进行舌苔脉象的辨证来进行中药汤剂的治疗。