扁桃体发炎时刺痛，考虑还是炎症的一种正常反应。本身扁桃体发炎就会出现疼痛、发热，甚至是化脓、感染等症状。所以对于扁桃体发炎引发的疼痛，还需要选择敏感的抗生素或者是其他的药物来积极的控制炎症，可以化验血常规看一下，如果是细菌感染，可以服用阿莫西林或者是头孢克肟，也可以加用清热解毒的中成药，如蒲地蓝消炎片。如果存在病毒感染，也可以适当用抗病毒药物来治疗。
扁桃体发炎时刺痛，患者要多喝水，清淡饮食，多吃含维生素C丰富的食物，一般炎症控制住以后，疼痛也会自然消失。如果疼痛比较厉害，也可以适当加用镇痛的药物。