血栓闭塞性脉管炎营养障碍期是脉管炎的第二期，此期缺血症状继续加重，间歇性跛行较明显，疼痛由间歇性跛行转为持续性静息痛，同时夜间症状加剧。患者的皮肤温度继续降低，色泽苍白，有的会出现紫斑、潮红、以及小腿肌肉萎缩，还有些患者皮毛会脱落，同时足背或者胫后动脉搏动消失。
此期的下肢动脉已处于闭塞状态，以器质性变化为主，参杂着一些功能因素，肢体依靠侧支循环保持存活，但是腰交感神经阻滞后，仍可出现皮温增高，症状得以改善。此期要积极的给予治疗，否则会进入坏死期，造成截肢的风险。