麻子仁丸的功效是行气通便、润肠泻热，临床上可以治疗胃肠有热、便秘的情况，可以用该药来治疗大便干结、小便频数等症状。对于身体虚弱、大病初愈的人出现的便秘，还有习惯性便秘，以及女性生产后导致的便秘、痔疮手术后出现的便秘等，都可以进行辅助治疗。
麻子仁丸是一个古方，在临床应用中要注意，孕妇要谨慎应用，平时津液亏少、贫血的患者也要谨慎应用。该药在应用过程中可以配合饮食，包括多吃蔬菜，少吃油脂类的食物，以及适当摄入蛋白。对于有基础病的患者，像糖尿病、冠心病等，应用该药也要小心，而且用药期间不能吸烟、饮酒，应规律作息，不要熬夜。麻子仁丸不能长期、大量应用，应该在医生的指导下合理进行用药。