儿童发生心肌炎，临床上的症状轻重不一，主要取决于患儿的年龄、体质、免疫功能，以及感染的病毒类型等多种因素。一般轻症的可以没有症状，或者仅有一过性心电图改变，也可能出现精神差、疲乏无力、没有食欲等非特异性症状，病情普遍都比较轻。
中型除上述症状多有充血性心力衰竭，起病都比较急，会出现拒食、面色苍白、呕吐、阵发性烦躁、哭闹、软弱无力、手足冰凉、呼吸困难，还可以出现干咳等。儿童会主诉心前区疼痛、头晕、头痛、心悸，个别还会出现腹痛、肌肉痛、烦躁、面色发干。重型主要表现急性或者慢性充血性心力衰竭的症状，症状与中型类似，少数孩子可以转为慢性。感染或者劳累可出现心衰反复发生，迁延数年，心脏、肝脏都变大，水肿明显，出现栓塞，甚至有心律失常的表现。