口腔细菌有许多种，可以根据与龋病和牙周病相关的细菌分为两类，主要分析如下：
一、致龋性细菌：
1、链球菌属：口腔内所有部位都能分离出链球菌，对牙菌斑形成起重要作用；
2、乳酸杆菌属：主要存在于龋病活跃的患者口腔内，是龋病主要致病菌。乳杆菌能够产生酸性物质，造成牙体组织脱矿，当口腔内蔗糖含量增高时，可以出现乳杆菌数量明显增加；
3、放线菌：可以发酵葡萄糖，产生乳酸，破坏牙齿根部、窝沟等部位形成龋损。
二、牙周致病菌：
1、放线杆菌：可以损伤牙龈和外周血中白细胞，导致白细胞死亡，释放溶酶体，造成牙周组织破坏；
2、牙龈卟啉单胞菌：容易黏附在颊黏膜、牙周袋上皮等处，分泌大量毒力因子引发牙周炎；
3、福赛坦氏菌：有较强的致病力，能产生内毒素，引起组织出血性坏死；
4、中间普氏菌：可以引发中度、重度牙周炎，急性坏死性溃疡及慢性牙周炎等。