肺脓肿是呼吸系统常见的感染性疾病，应该说大多数肺脓肿，通过临床症状、体征、胸部CT，发现肺部有脓肿伴液平，基本上就能够确诊，需要进一步明确导致肺脓肿的致病菌是哪一种，但是即便如此，如果在某一个疾病基础上继发感染、混合感染导致的肺脓肿，就很难单凭CT来明确诊断了。如结核基础上的肺脓肿，需要进一步的细胞学检查，才能排除在肺结核、干酪样肺炎的基础上混合感染导致的肺脓肿。
支气管肺癌继发感染导致的肺脓肿，临床胸片非常像肺脓肿，但通过经皮肺穿细胞学、组织学、病理的进一步检查，明确肺脓肿是在支气管肺癌基础上混合感染导致。因此大多数肺脓肿通过胸部CT，结合临床症状和体征就可以得到确诊，但是有其他疾病混合存在，还需要通过细菌学、细胞学、组织学的病理等，进一步明确诊断。