婴儿乳糖不耐受表现为在宝宝吃母乳或配方奶粉之后，三十分钟到两个小时之间出现腹泻，腹泻严重的一天可达十余次，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样、泡沫多、有奶块儿、呈酸臭味，并伴有腹胀、放屁多，常常带出少量粪便在尿布上。
呈痉挛性腹痛，导致宝宝爱哭闹，有的宝宝还伴有呕吐的现象。导致乳糖不耐受的真正原因是缺乏乳糖酶或乳糖酶活性低，不能完全分解母乳或牛奶中的乳糖。