幼儿心肌炎是由于病毒侵犯心脏所引起的，以心肌炎性病变为主要表现的疾病，也就叫病毒性心肌炎。常是由于病毒导致的，常见的病毒有柯萨奇病毒(B组和A组)、埃可病毒、脊髓灰质炎病毒、腺病毒、传染性肝炎病毒、流感和副流感病毒、麻疹病毒、单纯疱疹病毒，以及流行性腮腺炎病毒，都可以导致心肌的损伤。本病的发病机制目前尚不完全清楚，但随着分子病毒学、分子免疫学的进展，逐渐揭示出病毒性心肌炎发病机制，涉及病毒对感染的心肌细胞的直接损害，和病毒触发人体自身的免疫反应而引起心肌的损害。
在病毒性心肌炎急性期，柯萨奇病毒和腺病毒对细胞的直接损害，与心肌细胞的受体有关，病毒通过受体引起病毒复制和细胞变性，导致细胞坏死、溶解。机体的细胞和体液免疫反应，使机体产生抗心肌抗体，通过白介素-1、肿瘤坏死因子α和γ-干扰素，诱导产生的细胞黏附因子，促使免疫细胞有选择的像损害心肌组织黏附和浸润，导致的病毒性心肌炎。临床上的症状轻重不一，取决于年龄和感染的急性期和慢性的过程，预后大多良好，部分病人起病缓慢，有少数病人呈慢性的进展过程。