手足口疫苗夏秋季节打最好，因为手足口病一年四季均可发病，但夏秋季节发病率较高，这个时候打效果较好一些，注射适合于六个月龄到五岁的儿童，接种两剂，间隔28天，肌肉注射。
手足口病自2008年5月2日已被列入丙类传染病的管理，患者应隔离14天，易感人群应有良好的个人卫生习惯，勤洗手，注意玩具、餐具的消毒是预防的关键，加强疫情的监控，做到早发现、早诊断、早隔离、早治疗。我国已有自行研制的EV71灭活疫苗，并已经上市，对手足口病的治疗应该采取综合的治疗措施，注意充分的休息，加强营养，补充足够的水分，加强护理，对症治疗，如降温、镇静、止痛等，密切观察病情的变化，及早观察发现重症的病例，并及时采取治疗的措施以降低病残率和死亡率。