甲功三项是查游离三碘甲状原氨酸、游离甲状腺素和促甲状腺激素TSH，甲功五项时有的医院包括两个抗体，包括球蛋白抗体和微粒体抗体。有些医院甲功五项包括的是总T3、总T4，游离T3、游离T4以及调节甲状腺激素的促甲状腺激素。不同医院的组合不同，所以甲功五项的具体内容也是不一样的。
如果发生了桥本甲状腺炎，患者甲状腺激素水平可能正常，但是抗体一般是升高的。后期出现甲状腺功能，除了抗体升高，还可出现甲状腺激素水平下降，促甲状腺激素升高，应该给予左甲状腺素替代治疗。有的医院的甲功五项是包括总T3和总T4，并没有查甲状腺抗体，所以患者需要查抗体时应该再另外开单或者查甲功七项。