碱性磷酸酶和谷氨酸转肽酶升高，首先考虑有没有酒精性肝炎或者胆道系统的疾病。如果是酒精性肝炎引起的碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶升高，可以使用一些护肝、降酶类药物，例如复方甘草酸苷、甘草酸二铵、水飞蓟宾、还原型谷胱甘肽等。
如果考虑胆道系统引起的碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶升高，需要进一步完善腹部彩超检查。如果是胆道系统的炎症或者胆道结石引起的，需要进一步到肝胆科治疗；如果是胆道结石引起的，必要时有可能需要手术治疗；如果是胆道炎症引起的，可能需要抗感染治疗。