痢疾的传染源包括菌痢患者和带菌者，其中非典型患者、慢性患者及带菌者由于症状轻或无症状而易为误诊或漏诊，故在流行病学中作为传染源的意义更大。
其传播途径主要经粪-口途径传播，病原菌随患者粪便排出，通过污染、饮水、食物、生活用品或手经人、经口感染，苍蝇也是重要的传播者，如水源或食物被污染则可引起暴发流行。
人群普遍易感，病后可获得一定的免疫力，但短暂而不稳定且不同菌群及血清型之间无交叉免疫故易反复感染。
本病主要集中发生在发展中国家，尤其是医疗卫生条件较差的地区，终年散发带有明显季节性，夏秋季有利于苍蝇滋生、细菌繁殖，且人们喜食生冷瓜果食物故夏秋季多发。