慢性直肠炎可以使用谷氨酰胺肠溶胶囊、美沙拉嗪等药物治疗，同时还应保持大便通畅，避免刺激性食物摄入。谷氨酰胺肠溶胶囊对于各种原因引起的慢性肠道炎症，有不错的治疗效果，此药物属于肠黏膜营养剂，能够提高肠道黏膜保护屏障，促进肠道黏膜恢复，有利于慢性肠炎病情康复。
美沙拉嗪具有消炎、抗菌双重作用，药物能够在肠壁中发挥作用，并且药物持续时间比较长久。在服用之后还能够抑制前列腺素合成，从而可以达到缓解疼痛、消除炎症的作用。在使用药物治疗慢性直肠炎期间，还应当注意定时大便，避免出现便秘现象。如果出现便秘现象，就会对肠壁黏膜造成刺激，不利于炎症消退。患者在饮食上尽量以清淡为主，避免吃辛辣、刺激性食物，更有利于疾病治疗。