畸胎瘤是来源于生殖细胞的肿瘤，生殖细胞异常分化会导致肿瘤的形成，但是至今畸胎瘤的发病机制尚没有完全明确。畸胎瘤的发病诱因可能与以下因素有关，以下这些因素都是畸胎瘤的高危因素：
第一、有畸胎瘤的家族史，如果家族中有这种病史，患病畸胎瘤的风险就会增加。
第二、有遗传性疾病，比如柯氏综合征或者是特纳氏综合征，有一条额外或者是缺失的性染色体。
第三、中枢神经、生殖系统，还有下脊柱都存在先天的缺陷。
第四、输卵管畸胎瘤的来源至今不清楚，可能来自于迷走神经的生殖细胞。
畸胎瘤的发病病因至今不清楚，但是这些诱因会是高危因素。