胃部间质瘤严重与否取决于其良恶性，良性的胃间质瘤相当于良性肿瘤，一般直径小于2cm，可以在胃镜下进行微创切除，切除以后不会复发，也不会转移，术后不需要进一步治疗，预后非常好，定期复查就可以。
而胃恶性间质瘤属于恶性肿瘤，一般直径大于2cm，其治疗方法和胃癌相似，需要进行外科手术，术后视情况进行化疗，预后取决于病理分化程度，高危患者术后复发和转移的风险最高，预后也最差。
所以患者应该尽量做到早发现、早诊断、早治疗，发现胃肿瘤的最好的方法就是做胃镜。