小肠肿瘤比较少见，也没有特异性的临床症状，最常见的症状主要有腹痛、消化道出血、腹部包块，以及小肠梗阻等。腹痛是最常见的症状，可表现为隐痛、胀痛或者痉挛性疼痛，当并发肠梗阻时，疼痛特别明显。
消化道出血常表现为间断性排柏油样便，或者暗红色的血便，有的长期反复小量出血，而表现为慢性贫血。腹部包块一般位置不固定，活动度很大，常在洗澡或者在不经意时，摸到腹部有明显硬块、硬结。小肠梗阻最常见于肠套叠，由于肿瘤引起肠腔狭窄，或者压迫了邻近的肠管所致，也可诱发肠扭转。