格林-巴利综合征和脊髓炎是两个疾病，相同点都是神经系统的自身免疫性的疾病，不同点是发病的部位不同。格林-巴利综合征是发生在周围神经，是神经根部位，表现为四肢对称性、迟缓性的瘫痪、腱反射减弱、病理反射消失。患者可以做神经传导速度检查，发现神经传导速度减慢，做腰穿的时候可以发现脑脊液蛋白细胞的分离现象，蛋白增高，而细胞数正常。
脊髓炎发生的部位在脊髓，在损伤的脊髓节段的以下部分或者全部的感觉运动缺失，还可以伴有大小便的功能障碍，刚开始腱反射减弱，病理反射阴性。如果损伤这个平面很高，可以出现上运动神经元的损伤，病理反射可以是阳性。做腰穿可以发现脑脊液囊蛋白增高，细胞数可能也有所增高。