茵栀黄的副作用比较轻微时可能会出现胃肠道的症状，比如恶心、呕吐、腹泻、腹痛，有可能会出现咳嗽、头晕、头痛、胸闷等不良反应。如果是静脉给药有可能还会出现静脉炎或者局部麻木，严重的不良反应是出现过敏性休克，也有可能会出现呼吸困难、呼吸急促。另外，有溶血性贫血或者葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的患者是要禁用的。黄疸是属于寒湿阴黄者、虚黄引起面目萎黄者也是不宜使用的，茵栀黄是婴幼儿是禁用的，孕妇也是禁用的，老年人需要慎用。