子宫腺肌症的治疗，应该根据患者的症状、年龄和生育要求而制定，目前没有根治性的有效药物。
对于症状比较轻有生育要求及近绝经期的患者可试用达拉唑、孕三烯酮、GNRH或左炔诺孕酮宫内缓释系统进行治疗，这些都可以缓解症状，但需要注意药物的副作用，并且停药后这个症状会又出现。
在GNRH治疗时应注意患者骨丢失的风险，可给予反向添加治疗和钙剂的补充。
对于年轻和希望生育的子宫腺肌瘤患者，可试行病灶的切除术，但术后有复发风险。
对于症状比较严重并且没有生育要求，而且药物治疗无效的患者，应该行全子宫切除术，是否保留卵巢取决于卵巢有无病变和患者的年龄。