非典后遗症包括呼吸系统和运动系统两大系统疾病。
1、呼吸系统多见弥漫性间质纤维化、间质性肺炎、机化性肺炎、局灶性纤维化，因为肺纤维化可以导致肺的通气功能下降，会出现缺氧，患者平常有疲乏、容易出汗、气促、干咳、气短或全身的各个脏器缺氧。
2、运动系统，因为在治疗的过程中用大量的激素，导致的股骨头缺血性的坏死，骨关节滑膜炎。平常如果在严重的时候可能活动会受到限制，因为它不能负重太多，所以需要减轻我们的负重。有一些患者因为膝髋关节旋转受损，有疼痛或是短缩性的坡行。
3、精神障碍，因为在非典的时候恐惧、紧张会导致精神心理因素的改变，出现记忆力下降，注意力、工作能力降低等等。